Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTF1Q15361 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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