Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF4Q15306 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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