Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHPRHQ149N8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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