Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHD4Q14839 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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