Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCAPQ14761 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRCAPQ14761 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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