Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HNF4GQ14541 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HNF4GQ14541 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms