Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM25Q14258 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms