Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IKBKEQ14164 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKEQ14164 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms