Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCARF1Q14162 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARF1Q14162 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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