Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB33AQ14088 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB33AQ14088 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms