Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK13Q14004 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK13Q14004 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms