Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPSQ13938 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms