Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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DDX39BQ13838 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDX39BQ13838 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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DDX39BQ13838 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DDX39BQ13838 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DDX39BQ13838 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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