Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTAN1Q13813 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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