Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKD2Q13563 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKD2Q13563 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKD2Q13563 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKD2Q13563 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKD2Q13563 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PKD2Q13563 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PKD2Q13563 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKD2Q13563 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
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