Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTM1Q13496 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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MTM1Q13496 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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MTM1Q13496 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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MTM1Q13496 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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MTM1Q13496 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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MTM1Q13496 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTM1Q13496 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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