Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCIRG1Q13488 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCIRG1Q13488 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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