Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FOXE3Q13461 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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FOXE3Q13461 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXE3Q13461 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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