Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3BPQ13352 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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