Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF1Q13351 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF1Q13351 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF1Q13351 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF1Q13351 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF1Q13351 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF1Q13351 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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