Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF5Q13243 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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