Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR1H3Q13133 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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