Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CNTN1Q12860 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CNTN1Q12860 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CNTN1Q12860 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
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