Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMAGPQ0VAQ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMAGPQ0VAQ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms