Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD3Q0VAK6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD3Q0VAK6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms