Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms