Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms