Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms