Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC3A1Q07837 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms