Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBQ06643 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBQ06643 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LTBQ06643 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms