Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXOSC9Q06265 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms