Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN11Q06124 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms