Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DEUP1Q05D60 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEUP1Q05D60 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms