Protein–RNA interactions for Protein: Q05919

VPS38, Vacuolar protein sorting-associated protein 38, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS38Q05919 VID24YBR105C 1089 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 RIF1YBR275C 5751 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 HAA1YPR008W 2085 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 MES1YGR264C 2256 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 KEL2YGR238C 2649 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 POM152YMR129W 4014 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 BFR1YOR198C 1413 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YDL016CYDL016C 303 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 CRD1YDL142C 852 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 TIM11YDR322C-A 291 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YDR509WYDR509W 348 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 CHZ1YER030W 462 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YMR31YFR049W 372 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YJR141WYJR141W 1044 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 SWS2YNL081C 432 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 RCN2YOR220W 798 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 LCL1YPL056C 306 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YPR172WYPR172W 603 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 ARP8YOR141C 2646 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 PDR1YGL013C 3207 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 ICR1ICR1 3199 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 PSY2YNL201C 2577 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 APQ13YJL075C 417 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 RBL2YOR265W 321 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 RRG8YPR116W 834 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YPR203WYPR203W 309 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 JSN1YJR091C 3276 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 PRP8YHR165C 7242 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 MRM2YGL136C 963 nt2.78□□□□□ -1.96
VPS38Q05919 FLO11YIR019C 4104 nt2.78□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 TRZ1YKR079C 2517 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 FIN1YDR130C 876 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YKL066WYKL066W 444 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 COX14YML129C 213 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YMR144WYMR144W 1029 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 APC2YLR127C 2562 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 FUS1YCL027W 1539 nt2.77□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 RRI2YOL117W 1938 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 DAL5YJR152W 1632 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YDL009CYDL009C 324 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 GIC1YHR061C 945 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 ILM1YJR118C 612 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YLR202CYLR202C 327 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YOR055WYOR055W 435 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 TRM2YKR056W 1920 nt2.76□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YGL042CYGL042C 306 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 ERV1YGR029W 570 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YIL029CYIL029C 429 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YNL179CYNL179C 438 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 OST2YOR103C 393 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 SIP3YNL257C 3690 nt2.75□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 PRE1YER012W 597 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YIR020CYIR020C 303 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YLR252WYLR252W 306 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 HSP10YOR020C 321 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YOR331CYOR331C 558 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 COG3YER157W 2406 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 SPB1YCL054W 2526 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 MET6YER091C 2304 nt2.74□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 HPA3YEL066W 540 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 BET4YJL031C 984 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 NYV1YLR093C 762 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 RIO2YNL207W 1278 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 TRS20YBR254C 528 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 CWC22YGR278W 1734 nt2.73□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YKR078WYKR078W 1758 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 IST3YIR005W 447 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 PAU23YLR037C 375 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 ALG14YBR070C 714 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 UTP14YML093W 2700 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 NPR3YHL023C 3441 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 SPR3YGR059W 1539 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 SKT5YBL061C 2091 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 PTP3YER075C 2787 nt2.72□□□□□ -1.97
VPS38Q05919 YLR001CYLR001C 2589 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 RLF2YPR018W 1821 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 DFG10YIL049W 762 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 HRI1YLR301W 735 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 BER1YLR412W 825 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 YOL150CYOL150C 312 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 RRD2YPL152W 1077 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 YPR096CYPR096C 303 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 NPR1YNL183C 2373 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 SNF12YNR023W 1701 nt2.71□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 VPS64YDR200C 1815 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 ESC1YMR219W 4977 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 MTC7YEL033W 420 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 FYV4YHR059W 393 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 UBX4YMR067C 1251 nt2.7□□□□□ -1.98
VPS38Q05919 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.6 ms