Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms