Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACVR1Q04771 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACVR1Q04771 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms