Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN1Q04323 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN1Q04323 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms