Protein–RNA interactions for Protein: Q03338

PRP3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP3Q03338 SRL4YPL033C 846 nt2.58□□□□□ -2
PRP3Q03338 NPR3YHL023C 3441 nt2.58□□□□□ -2
PRP3Q03338 MCD1YDL003W 1701 nt2.58□□□□□ -2
PRP3Q03338 TLC1TLC1 1301 nt2.58□□□□□ -2
PRP3Q03338 ALY1YKR021W 2748 nt2.58□□□□□ -2
PRP3Q03338 NAB3YPL190C 2409 nt2.58□□□□□ -2
PRP3Q03338 YDR338CYDR338C 2088 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 YKL222CYKL222C 2118 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 PUF4YGL014W 2667 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 BCK1YJL095W 4437 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 KSP1YHR082C 3090 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 YCR099CYCR099C 468 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 MPO1YGL010W 525 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 PCK1YKR097W 1650 nt2.57□□□□□ -2
PRP3Q03338 RSM18YER050C 417 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 YGR053CYGR053C 852 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 SDS22YKL193C 1017 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 UTP30YKR060W 825 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 RNP1YLL046C 750 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 YLR012CYLR012C 300 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 ATG3YNR007C 933 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 ESC2YDR363W 1371 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 IRC8YJL051W 2469 nt2.56□□□□□ -2
PRP3Q03338 VPS13YLL040C 9435 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 YDR250CYDR250C 276 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 YGR107WYGR107W 450 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 MBB1YJL199C 327 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 PAU8YAL068C 363 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 YEL1YBL060W 2064 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 YAP7YOL028C 738 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 PAU20YOL161C 363 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 YOR283WYOR283W 693 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 YPR097WYPR097W 3222 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 POL3YDL102W 3294 nt2.55□□□□□ -2
PRP3Q03338 SHS1YDL225W 1656 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 REF2YDR195W 1602 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 APM3YBR288C 1452 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 PBP4YDL053C 558 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 YGR018CYGR018C 330 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 YAL037WYAL037W 804 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 MRP49YKL167C 414 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 COA4YLR218C 453 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 IRC21YMR073C 606 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 RGM1YMR182C 636 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 RRT16YNL105W 429 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 PAM1YDR251W 2493 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 RGA2YDR379W 3030 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 SIP3YNL257C 3690 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 RLF2YPR018W 1821 nt2.54□□□□□ -2
PRP3Q03338 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.53□□□□□ -2
PRP3Q03338 snR5snR5 204 nt2.53□□□□□ -2
PRP3Q03338 YDL163WYDL163W 303 nt2.53□□□□□ -2
PRP3Q03338 SMA2YML066C 1110 nt2.53□□□□□ -2
PRP3Q03338 YNL235CYNL235C 432 nt2.53□□□□□ -2
PRP3Q03338 ESF2YNR054C 951 nt2.53□□□□□ -2
PRP3Q03338 SSP1YHR184W 1716 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 SNO3YFL060C 669 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 MND1YGL183C 660 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 SNO2YNL334C 669 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YRR1YOR162C 2433 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 DNF1YER166W 4716 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 CTF13YMR094W 1437 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 AIM19YIL087C 474 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YOR152CYOR152C 771 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 ARL3YPL051W 597 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 GIN4YDR507C 3429 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 RAV1YJR033C 4074 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 SEC26YDR238C 2922 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 PPH3YDR075W 927 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 PAU23YLR037C 375 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 VPS63YLR261C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 COX8YLR395C 237 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 RPS17AYML024W 411 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YMR254CYMR254C 309 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 SNU114YKL173W 3027 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 INP53YOR109W 3324 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 CBF2YGR140W 2871 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 NOP14YDL148C 2433 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YDR115WYDR115W 318 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 SDC1YDR469W 528 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YER189WYER189W 369 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YGR226CYGR226C 210 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YKL123WYKL123W 381 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 TPK2YPL203W 1143 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YCL007CYCL007C 393 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 ORC1YML065W 2745 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 AYT1YLL063C 1425 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 BFR1YOR198C 1413 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 VPS64YDR200C 1815 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 COG3YER157W 2406 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 UBX3YDL091C 1368 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 YEL043WYEL043W 2871 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP3Q03338 NCS2YNL119W 1482 nt2.48□□□□□ -2.01
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