Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms