Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms