Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NHLH2Q02577 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms