Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms