Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPEQ02224 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPEQ02224 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms