Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLCB3Q01970 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms