Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A3Q01959 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms