Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTBN1Q01082 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTBN1Q01082 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms