Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1BQ01064 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms