Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF9Q00978 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms