Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1BQ00975 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms