Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK5Q00535 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms